撤离云州星的命令传达下去之后，前进舰队所有单位立即开始进行撤退前的准备，大量的物资流水一般送上战舰，无数机械人忙得团团直转，愿意和舰队一起撤走的克隆人全部送上战舰冷冻起来。
虽然克隆人只在云州城里生活了一年多的时间，但这里是他们家园，国人固有的乡土情节难以避免地出现在克隆人身上，愿意跟舰队走的只有三分之一不到，剩下的克隆人宁肯面对亚特兰蒂斯人的炮火，也不愿意离开自己的家园。
叶飞没法强迫他们，也没有能力带走所有的克隆人，除了给他们留下一批机械人之外，能做的就只有再给他们留下一批武器。
所有人心里都知道留下的克隆人不是亚特兰蒂斯人的对手，不过拥有一些武器，多少能带来一点安全感。
在这方面叶飞倒是一点也不吝啬，甚至拆下了战神号上三分之二的晶体导弹，另外还有近千枚光速鱼雷。
ym174一役没用上光速鱼雷，各舰的储备基本上都没怎么动用，加上云州星这几个月的产量，一共也就是一千五百枚左右，留下这批光速鱼雷之后，每艘战舰的备弹只剩下二十枚而已，还不到正常基数的一半儿。
舰队是要撤离云州星，而不是执行作战任务，完全没有必要带那么多光速鱼雷，而且省出来的空间还可以带上一些必要的物资，比如从基地星带回来的超重元素晶体。
十几个小时之后，从湖州星逃出来的五艘战舰逃回云州星，段平立即安排一批机械人对这五艘舰队进行全面检修。
除了云州星之外，就只有地球边缘的临时基地拥有维修战舰的能力，不调整好战舰的状态。万一在飞向新星系的过程中出了什么故障，就只能放弃宝贵的战舰。眼下整个前进舰队只剩下二十三艘战舰，叶飞一艘战舰也损失不起。
唯一值得庆幸的是湖州舰队从来没拥有过战神级战舰，缺乏补给战神级的的经验。因而叶飞派往湖州星的全部是天鹰级战舰。
不过这点便宜不提也罢。
前进舰队忙得脚打后脑勺。亚特兰蒂斯舰队也好不到哪儿去。
一直躲藏在云州星附近，监视云州星的亚特兰蒂斯战舰很快就注意到了云州星的异常。得到消息的微里安德和支援舰队轻而易举地判断出云州星的人类舰队很可能是要逃跑，可限于战舰的速度，短时间内根本赶不到云州星，只能一边全速飞向云州星。一边盼着云州星的异常不是为了逃走。
不过他们再怎么着急也没有用，战舰的速度跟不上，就只有干瞪眼儿的份儿。
别看亚特兰蒂斯人从地球上抓走了不少人类，可是除了核武器的制造方法之外，挖空心思的亚特兰蒂斯人再没能从人类身上得到丁点好处。
亚特兰蒂斯人最感兴趣的就是人类战舰的动力系统，可惜从地球上得到的是磁力引擎技术，速度最高只有百倍光速。根本就不是他们想要的。
出现这种情况一点不奇怪，共和国军方得到超重元素晶体原本就是机密中的机密，知情的不是派到远离太阳系的战舰上，就是派到了猎户座大星云。留在地球上的两亿国人压根儿就没谁知道这个情况，外国人就更不要提了，国家安全局和总参二部的能力还是很强的。
话说回来，就算让亚特兰蒂斯人知道晶体引擎的详情，他们也没地方开矿，照样还是干瞪眼儿没辙。
2216年9月1日，湖州星遭到袭击的三天之后。
在段平的指挥下，两艘只建好骨架的战舰按计划完工，除了百十平方的驾驶舱之外，长达十五公里的巨舰再没有压力空间，丑陋狰狞的外壳到处支楞着不堪入目的边角零碎，而且为了加快速度，原本只打算用来堵漏的“冰冻法”被大量应用于外壳的建造，只要有一束光芒扫过这两艘战舰，就会映出一片星空般的反光。
这两艘战舰实在是太粗糙了，叶飞根本不敢把冷冻的舰员或者克隆人装进去，也不敢存放至关重要的粮食给养，只能存放不重要的物资，主要是以机械人为主。
经过两年多的建设，云州星系拥有机械人上数百万台，将这两艘战舰塞满绰绰有余。
物资的搬运又持续了两天，直到9月3日，舰队才将将做好撤离的准备，没法撤走的宇宙基地和卫星工厂干脆塞上核弹，不过叶飞并没有爆破这些设备，而是将引爆的权力交给了留在云州星上的克隆人。
假如亚特兰蒂斯人没有袭击云州星的话，克隆人完全可以将这些基地和工厂利用起来。
段平对此很不理解，他很担心克隆人会在舰队离开之后投靠亚特兰蒂斯人，他不希望这些设备落在亚特兰蒂斯人手上。
不过叶飞很有信心，因为无论宇宙基地还是卫星工厂内的爆破装置都连接在共振通讯仪上，万一出现不可控的情况，直接远程引爆就完事了。
2216年9月3日晚七时，叶飞率领前进舰队离开云州星。
此时亚特兰蒂斯人的舰队距离云州星还有两天的航程，监视云州星的敌舰在舰队即将启航的关键时刻冲入云州星，试图拖住舰队撤离的脚步。
为了侦察人类的情况，亚特兰蒂斯人放出了二百多艘战舰执行侦察任务，发现云州星之后，不少敌舰聚集到云州星附近，大概有十几艘的样子。
十几艘三角战舰的出现让叶飞错以为是大批敌军即将到来，毫不犹豫地下达了出发的命令。
以战神号为首的二十三艘战舰外加两艘粗制滥造版的运输舰迅速进入超光速状态，直接扔下了一点办法都没有的监视舰队。
离开云州星之后，前进舰队兵分两路，一路直飞允州，另一路飞往凌州，两支舰队将在这两颗殖民星停一段时间，按照云州星的方法带走自然人，安置克隆人。