不过，姬矢准在原剧情中只和浮士德还有梅菲斯特对线过，和扎基对线的，是西条风和孤门一辉。
徐明要做好两手准备，虽然原剧情中黑暗扎基是最后出现的，但现在有了自己这个变故，难保不会提前爆发。
不过，想要对付黑暗扎基的并不止徐明和奈克瑟斯两个。
还有那些从m80天蝎座球状星云化作光量子来到地球的“来访者”。
黑暗扎基，其实就诞生在这些“来访者”的手中。
在很久以前，“来访者”们的星球也遭受到了异生兽的入侵。
在那个星球上，也有好几个人获得了诺亚奥特曼的光之力量，并且一一传承。
然而有一天，能量不足的诺亚陷入了沉眠，光之力量出现了空缺，异生兽开始肆无忌惮地横行……
于是，来访者们便对诺亚奥特曼的外表进行仿造，制作出了一个和诺亚极为相似的奥特曼。
名为扎基。
一开始，扎基确实在帮助来访者们消灭异生兽，但后来扎基知道自己只是个仿制品之后，便堕入了黑暗。
接着开始增殖异生兽，并且控制异生兽。
那颗星球的人们为了消灭异生兽和黑暗扎基，不得不引爆了自己的星球，产生超新星爆炸。
但是……黑暗扎基依旧活了下来。
不过诺亚也再次复苏，并且在超新星爆炸之中和黑暗扎基一同进行了一场超越时空的战斗。
最终，扎基被击败，并且来到了这个地球。
诺亚也失去了能量再次沉眠，并且开始寻找适能者。
扎基来到地球之后占据了一个名叫山冈一的人类科学家的身体，并且抹除了这个科学家的意识。
最终，将山冈一的名字改名为石崛光彦。
至于来访者们放弃了类人的形态，变成了光量子在宇宙中散播关于异生兽和扎基的讯息，避免其他星球受到侵害。
部分来访者来到了地球，为地球防卫带来了究极科技和智慧，在这里协助人类对付异生兽。
……
t总部。
预知者吉良泽优穿着一身白衣，坐在满是计算机的房间之内。
在这房间的上空还漂浮着几朵水母。
这些没有水就可以漂浮的水母并非真正的水母，而是“来访者”在地球上的一种表现形态。
“光之巨人出现在地球上了，并且已经挑选了适能者。”
预知者面色平静，缓缓开口说道。
适能者，并没有出现在夜袭队这支精锐之中。
在预知者还小的时候，便看到了黑暗扎基让这个世界陷入末日之中的画面。